LightScanner HRM
高分辨熔解曲线突变检测系统

"The finest platform in the world today for mutation analysis" Lightscaner
      - Dr. Claire Taylor, University of Leeds, UK

技术支持
 

HRM 的应用领域:

1 .基因的突变扫描。检测杂合子 SNP 、区段 / 碱基缺失、前后重复、杂合子缺失。
相关研究方向:
1 )   样本中特定突变位点( SNP )的筛查,包括一个片段中多个位点的复合杂合突变的Genotyping。
2 )   疾病相关基因(癌基因)特定区段突变位点的扫描,新突变的发现。
3 )   遗传育种中特定突变的筛查、未知突变的发现。
4 )   植物抗逆性,突变与性状关联性的研究。
5 )   动植物品质相关多态性位点的研究等。

例如:
1 )   临床癌症病人特定 SNP 的高通量筛查。
2 )   单碱基错译突变的筛查。
3 )   新突变的寻找。
4 )   植物遗传育种。
5 )   大片段序列变化的检测。

2 . HLA 基因组配型
器官移植的 HLA 配型、同胞之间 HLA 基因型确定。
如快速确定 HLA 高度多态性位点的类型,及非亲源关系个体间异源造血干细胞移植前的 HLA 基因型确认 。

3 .等位基因频率分析

4 .物种鉴定、品种鉴定
1 )   微生物品种、物种快速鉴定。
2 )   动植物品种鉴定。

5 .甲基化研究
1 )   甲基化位点的筛查。
2 )   甲基化程度分析。
用 HRM 方法检测启动子区域内的甲基化,可检测低达 0.1% 的甲基化程度;并根据已知甲基化程度的标准曲线对未知样品的甲基化百分比进行测定。 HRM 是一种高灵敏度的甲基化检测方法,并且其高度的重复性和低成本将对肿瘤的研究和临床应用有很大帮助。

6 .法医学鉴定、亲子鉴定。

检测单核苷酸多态性 SNP 鉴定,插入 / 缺失多态性 DIP 鉴定等
将 HRM 用于法医学 SNP 、 DIP 鉴定,协助犯罪鉴定,亲子鉴定。相对于传统鉴定方法, HRM 是一种简单、便宜、高通量的二等位基因分子标记鉴定的方法

 


LightScanner 工作流程

在PCR反应前将LC Green荧光染料与反应Buffer、引物、模版DNA混合,LC Green染料饱和加入(LC Green荧光染料对PCR不会有任何抑制作用),然后将PCR产物(96孔板或者384孔板)放入LightScanner中,在一定的温度范围内将PCR扩增产物进行变性,在此期间,仪器的光学检测系统采集密集的荧光信号变化并绘制溶解曲线,根据曲线准确区分野生型、杂合突变、纯和突变,软件自动分型。LightScanner为高通量、高分辨率、高灵敏度检测手段,检测成本及低,通过上述检测分型之后,只有约1%的PCR产物需要测序,因此极大的降低了测序的工作量,节省费用。


 
   
   
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